長期以來，伊斯蘭主義一直是中國與巴基斯坦關系中的一根刺。1989年蘇聯撤出阿富汗后，巴基斯坦的伊斯蘭主義者決意要與中國的穆斯林分裂勢力建立緊密關系。他們在以穆斯林人口為主的西部省份新疆示好。有些人甚至認為，在中國創建一個伊斯蘭共和國是可能的。由此導致的外交緊張深深地困擾著雙方的政策制定者。

如今，巴基斯坦的伊斯蘭主義者不再夸耀要讓中國教友們變得激進的雄心。相反，他們現在把北京方面視作可信賴的朋友。華盛頓皮尤研究中心(Pew Research Center)近期的調查結果顯示，在更廣泛的民眾中，有多達四分之三的受訪者對美國持負面看法。對于巴基斯坦的這個最大盟友，大部分人更多的是把它視作敵人，而非朋友，擔心它可能成為一個軍事威脅。

“中巴友誼是巴基斯坦穩定的一個重要保障，”主流宗教性政黨“伊斯蘭大會黨”(Jamaat-e-Islami)的高級領導人利雅卡特?巴洛奇(Liaquat Baloch)表示，“中國在與他國交往時沒有任何議程，而美國的外交議程盡是怎么干涉別國事務?！?/p>